Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms