Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DMDP11532 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DMDP11532 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DMDP11532 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DMDP11532 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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