Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGB3P05106 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms