Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms