Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms