Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RGPD3A6NKT7 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms