Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID3CA6NKF2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms