Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEF22A3QJZ6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms