Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D4Q9Y2X8 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms