Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms