Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APEX2Q9UBZ4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms