Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms