Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms