Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
KIAA1549Q9HCM3 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms