Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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