Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BBS2Q9BXC9 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BBS2Q9BXC9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms