Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms