Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms