Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SEMA3CQ99985 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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SEMA3CQ99985 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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