Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NELL2Q99435 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms