Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316.8 ms