Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGF29Q96ES7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms