Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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