Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTTNBP2Q8WZ74 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms