Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMO3Q8TAP4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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