Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD1Q8NHV4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms