Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF397Q8NF99 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms