Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms