Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms