Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFWD3Q6PCD5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms