Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms