Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
FRMPD1Q5SYB0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FRMPD1Q5SYB0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FRMPD1Q5SYB0 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FRMPD1Q5SYB0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms