Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms