Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms