Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ZNF239Q16600 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ZNF239Q16600 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ZNF239Q16600 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ZNF239Q16600 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ZNF239Q16600 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ZNF239Q16600 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ZNF239Q16600 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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ZNF239Q16600 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms