Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 KIAA1755-201ENST00000279024 6429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 COL5A2-203ENST00000618828 6399 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZNF423-207ENST00000567169 4017 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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