Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC3Q15034 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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