Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUL4BQ13620 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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