Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FOXF1Q12946 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FOXF1Q12946 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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FOXF1Q12946 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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FOXF1Q12946 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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