Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms