Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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