Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms