Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms