Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN12Q05209 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms