Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms