Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms