Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFC1P60507 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFC1P60507 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFC1P60507 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms