Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
LINC01547P58512 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms