Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 RN7SL519P-201ENST00000497925 288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSEN1P49768 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms