Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms